2003年，雅库布从海法马卡比租借加盟朴茨茅斯，帮助球队完成升级后，这笔交易转为永久转会。2002/03赛季是朴茨茅斯连续第11个赛季征战英格兰第二级别联赛，球迷们对球队在积分榜下游徘徊感到越来越沮丧。时任主帅哈里·雷德克纳普希望，在自己完整执教的首个赛季里，能够稳定军心，并逐步推动球队向升级区迈进。随后发生的事情，成为弗拉顿公园球迷难以忘怀的一个赛季——南海岸球队在大部分时间里领跑积分榜，最终提前几轮夺得联赛冠军。
那个赛季对朴茨茅斯未来十年的发展方向起到了关键作用，而签下一名前锋的决定被证明是俱乐部上下的神来之笔。朴茨茅斯上半赛季表现强势，老板米兰·曼达里奇急于补强阵容，确保球队能在赛季末的升级争夺中保持竞争力。2003年1月，朴茨茅斯从海法马卡比租借雅库布，后者立即产生巨大影响——前三场比赛打入三球，包括对阵德比郡时的梅开二度。接下来的几个月里，他的状态持续火热，尽管只在英冠联赛为朴茨茅斯出场14次，但对手后卫极难应付他，他总共攻入7球。
朴茨茅斯一路高歌猛进夺得冠军，锁定了2004/05赛季的英超席位。球迷们希望这位租借前锋能在短暂租借后永久留队，雷德克纳普也有同样想法。那年夏天，朴茨茅斯以400万英镑签下雅库布，为顶级联赛征程做准备。进入英超后，人们或许会怀疑朴茨茅斯签下一名在英格兰经验尚浅的前锋是否正确。但雅库布没有丝毫紧张，立即证明了自己的价值——在英超仅第二场比赛就取得进球，球队开局五场不败。他的状态持续走高，成长为一名极具杀伤力的前锋，整个赛季37场比赛打入16球，朴茨茅斯最终排名第13位，证明他们属于英超。
2005/06赛季对球员和球队来说都更为艰难，但这并未阻止这位前尼日利亚国脚再次在英超进球上双——在雷德克纳普离队后的调整期，他30次出场攻入12球。2006年夏天，他引起了米德尔斯堡的注意，最终以750万英镑离开弗拉顿公园。在欣赏了雅库布身穿蓝色战袍的两年半精彩表现后，朴茨茅斯从这笔交易中获得了可观的利润。